С.П.Петруня родился в 1899 году на Киевщине. В 1927 году окончил Киевский университет. Врач-офтальмолог. Искал место врача-окулиста на бирже труда и, по его словам, был сражен, когда в списках вакансий увидел запись: «Старобельская глазная больница. Должность главного врача». Он и города такого не знал, а там, оказывается, есть глазная больница!
В Старобельскую окружную глазную больницу Степан Пантелеевич приехал и заменил скончавшегося в конце августа 1926 года В.А.Шафрановского. Молодой врач быстро понял, что его предшественник был офтальмологом высокой квалификации, имел необычайный авторитет у коллег и населения. А это обязывало ко многому.
Глубокая научная подготовка, талант и необычайная работоспособность молодого главного врача помогли ему быстро накопить необходимый опыт, завоевать признательность коллег и населения Старобельщины. Многие сотни старобельчан и жителей соседних районов до конца дней своих были благодарны ему за возвращение зрения или избавление от глазных болезней. Он был достойным и талантливым продолжателем дела, которое было заложено в Старобельске В.А.Шафрановским.
Уйдя на преподавательскую работу в Луганский медицинский институт, С.П.Петруня ведет активную научную работу. В институте он заведует кафедрой, становится профессором, доктором наук, заслуженным врачом Украины. У него много учеников и последователей, а главное – он глава целой династии врачей-офтальмологов.
За выдающиеся научные достижения и плодотворную педагогическую деятельность С.П.Петруня награжден орденом Ленина, был Почетным гражданином города Луганска.
Умер в 1992 году.